La Junta Intermunicipal de Medio Ambiente para la Gestión Integral de la Cuenca del Río Ayuquila (JIRA) es un organismo que promueve acciones de gestión ambiental y gobernanza territorial. Su función principal consiste en brindar capacitación y asesoría técnica para la operación de proyectos que fomenten la protección, conservación y restauración de los ecosistemas, así como de los servicios ambientales en la región de la cuenca. Esta labor se lleva a cabo gracias a la participación de los gobiernos de los diez municipios que conforman el territorio, junto con instancias del gobierno estatal y federal, asociaciones civiles y la iniciativa privada.